Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtskP55097 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtskP55097 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtskP55097 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtskP55097 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtskP55097 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtskP55097 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtskP55097 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtskP55097 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtskP55097 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtskP55097 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtskP55097 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtskP55097 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtskP55097 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms