Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms