Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PctpP53808 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PctpP53808 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PctpP53808 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PctpP53808 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms