Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux1P53564 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux1P53564 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cux1P53564 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms