Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms