Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms