Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RorcP51450 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RorcP51450 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RorcP51450 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms