Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms