Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpdP50404 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms