Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms