Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms