Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3P48787 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms