Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccr7P47774 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr7P47774 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms