Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms