Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms