Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf5P43027 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf5P43027 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms