Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3caP42337 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms