Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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