Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chd1P40201 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd1P40201 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd1P40201 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms