Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtlP38585 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TtlP38585 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TtlP38585 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtlP38585 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms