Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2aP35436 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2aP35436 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms