Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms