Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms