Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms