Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pabpc1P29341 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms