Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RxraP28700 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RxraP28700 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RxraP28700 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RxraP28700 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RxraP28700 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RxraP28700 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RxraP28700 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RxraP28700 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RxraP28700 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RxraP28700 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RxraP28700 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RxraP28700 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RxraP28700 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms