Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apex1P28352 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms