Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms