Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CebpbP28033 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CebpbP28033 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CebpbP28033 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CebpbP28033 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CebpbP28033 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CebpbP28033 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CebpbP28033 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CebpbP28033 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CebpbP28033 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CebpbP28033 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CebpbP28033 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms