Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms