Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CftrP26361 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CftrP26361 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CftrP26361 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CftrP26361 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CftrP26361 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CftrP26361 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CftrP26361 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CftrP26361 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CftrP26361 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CftrP26361 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CftrP26361 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CftrP26361 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CftrP26361 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CftrP26361 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CftrP26361 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CftrP26361 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CftrP26361 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CftrP26361 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms