Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms