Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms