Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms