Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fcer1aP20489 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fcer1aP20489 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fcer1aP20489 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fcer1aP20489 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fcer1aP20489 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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