Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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