Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox5bP19536 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms