Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NefhP19246 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NefhP19246 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NefhP19246 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NefhP19246 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NefhP19246 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms