Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms