Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpraP18052 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms