Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms