Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rag1P15919 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rag1P15919 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms