Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30aP15533 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms