Protein–RNA interactions for Protein: P14869

Rplp0, 60S acidic ribosomal protein P0, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp0P14869 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rplp0P14869 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp0P14869 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms