Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp54P14576 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms