Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-D1P14427 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-D1P14427 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-D1P14427 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms