Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms