Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amd1P0DMN7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms