Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd1P03888 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd1P03888 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms