Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HbaP01942 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HbaP01942 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HbaP01942 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HbaP01942 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HbaP01942 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HbaP01942 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HbaP01942 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HbaP01942 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HbaP01942 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HbaP01942 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HbaP01942 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HbaP01942 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms